阴蒂肥大常为假两性畸形的一项诊断依据，故临床上首先应排除是否有女性假两性畸形的可能。阴蒂肥大者，对女性来说，多影响心身健康。因此因请整形美容患者尽快进行有效的根治。
治疗不应在月经期及妊娠期进行，术前3天开始清洗外阴。治疗方法有两种，即阴蒂切除术和阴蒂阴唇成形术。
（1）阴蒂切除术
取截石位，局部麻醉，将阴蒂于根部切断，创面直接缝合。本术式的缺点是：由于将阴蒂的神经血管以及阴蒂海绵体切除，术后阴蒂的性反应敏感程度有较大的降低，影响性快感的产生。
（2）阴蒂阴唇成形术
取截石位，局部麻醉，在肥大的阴蒂背侧皮肤做“工”形切开，向两侧剥离形成两个皮瓣，分别折叠缝合成部分小阴唇。小心将阴蒂背侧血管神经分离至阴蒂根部，慎勿损伤，根据肥大程度切除部分阴蒂海绵体，楔形切除肥大的阴蒂头部，以缩小阴蒂，最后将其缝合固定于阴蒂根部。即可形成较正常形态的女性外生殖器，同时保留了阴蒂头的性反应能力。
